El Museo Histórico y Cultural de Cauquenes fue fundado por su director, Franklin Martínez Rivas, el 28 de mayo de 2021, coincidiendo con el Día del Patrimonio Cultural de Chile. Esta iniciativa surgió como respuesta a la ausencia de un espacio museístico en la ciudad. Además, el director administra hasta la actualidad, un grupo en Facebook llamado "Cauquenes de Antaño". En esa plataforma, se incorporan investigaciones que rescatan la historia local, publicando los hallazgos para preservar y compartir el patrimonio de la comunidad. Con el propósito de materializar su idea, propuso a los miembros de esta comunidad virtual, colaborar en la creación del museo. La propuesta fue bien recibida, y los participantes contribuyeron entregando fotografías antiguas, antigüedades y piezas culturales, además de ofrecer un lugar físico para el funcionamiento del museo.

Tras inaugurar el espacio bajo el nombre de Museo Histórico y Cultural de Cauquenes, el director dio un paso más organizando una agrupación cultural con personalidad jurídica para gestionar y fortalecer las actividades del museo. Finalmente, el 28 de abril de 2025, la Ilustre Municipalidad de Cauquenes llevó a cabo la reinauguración del museo, trasladándolo a su nueva sede en la Casa de la Cultura de Cauquenes. Por medio de un comodato firmado entre la Agrupación Cultural y la Administración Municipal, el museo pasó a formar parte del patrimonio público de Cauquenes, consolidándose como un museo municipal accesible para toda la comunidad.