El Monumento Natural Los Pingüinos está formado por los territorios que comprenden las Islas Magdalena y Marta, las que en conjunto suman una superficie de 97 Hás.

La Isla de Mayor tamaño es Magdalena, con 85 hás. Geográficamente se ubican en las coordenadas 52° 52'09" Latitud Sur y 70 y 38 Km. al noreste de la ciudad de Punta Arenas, respectivamente. El acceso se realiza principalmente por vía marítima, donde distintas agencias de turismo prestan servicios turismo y navegación que permiten el acceso a la isla permitiendo la visita al Monumento Natural Los Pingüinos.

La circulación interna se permite solo en Isla Magdalena a través de un sendero peatonal de una extensión de 850 mts. En isla Magdalena se emplaza el faro, el cual es es propiedad de la Armada de Chile, y fue traspasado a Conaf con fecha 12 Febrero de 1981 mediante un contrato de comodato. La superficie edificada es de 318 m2 y comprende dependencias habitacionales, un faro, área administrativa y el Centro de Información Ambiental.