La casa que ocupa el Museo Militar Tarapacá de la VI División de Ejército, corresponde a un inmueble de antigua data histórica en la ciudad de Iquique. En noviembre de 1879, el entonces sitio eriazo paso a ser propiedad del Fisco-Gobierno de Chile, que lo enajenó a don Santiago Peake en 1887 con una superficie de 340 m2. Este, construyó la actual casa que recibió el número 162 de la calle Baquedano.

En 1909 la propiedad fue adquirida por don George V. Peake, pasando a funcionar la Nitrate Agencies Limited hasta 1917, en que fue a su vez adquirida por don Jorge Braithwite, quien fue dueño de la misma hasta 1924. En esa fecha la casa cambia la numeración y recibió el Número 1396 que conserva hasta la actualidad.​ En los años posteriores, la propiedad tuvo nuevos propietarios, entre ellos, Carlos Brunson desde 1924 a 1934 y el matrimonio de Nicolás Vilaplana y María Gaju de Vilaplana hasta 1943, en que el inmueble fue adquirido por el Fisco-Ejército de Chile que lo destino a casa habitación del Comandante del Grupo de Artillería a Caballo Nº1 "General Salvo", y posteriormente, como casa comando del Regimiento de Artillería Nº 6 "Dolores", Casino de Suboficiales, Casa del Soldado y finalmente Museo Militar Tarapacá.

El Museo Militar, fue creado en 1969 por el entonces Comandante en Jefe de la VI División de Ejército, General de Brigada Augusto Pinochet Ugarte y su sede original fue en calle Latorre 473. Posteriormente y en 1998, siendo Comandante del Primer Cuerpo de Ejército el General de División Sergio Moreno Saravia, pasó a ocupar su actual ubicación bajo el nombre de Museo Militar Tarapacá. ​El antiguo edificio fue finalmente remodelado en los años 2009 y 2010 bajo la gestión de mando del General de División Eduardo Gárate Neumann y el General de Brigada Sergio Béjares Von Chrismar, gracias a la colaboración del Ejército de Chile, la Corporación de Conservación y Difusión del Patrimonio Histórico Militar y el apoyo de la Compañía Minera Doña Inés de Collahuasi.