El Museo de la Universidad Adventista toma como base el Centro de Recursos Creacionistas (CRC) creado en la institución el año 2013. Este centro es el cuarto en Sudamérica (después del de Brasil, Perú y Argentina), siendo parte de una red de Centros de las mismas características dependientes del Geoscience Research Institute, que tiene su sede en Loma Linda, California, Estados Unidos.

Desde esa fecha, el centro ha sido un espacio de investigación y difusión en temas de ciencia y fe, especialmente en geología y paleontología, con una óptica científica y cristiana. Dadas estas características, el centro comenzó a recibir diversas donaciones de artefactos y bienes culturales las que se musealizaron dando origen al Museo de la Universidad Adventista de Chile.

Desde el 2026 se integra el Centro Histórico de la universidad adjuntando una mirada hacia el patrimonio local y regional.