El museo se funda en el año 2019 como una Sala Museográfica en la escuela básica Carlos Condell en Caleta Andrade. Convirtiéndose en el primer museo de la comuna de Aysen.
Esto se concreta gracias a una alianza entre el gestor de la iniciativa museo, su hermana Sofia Matissine y la escuela de Carlos Condell. La iniciativa parte de la preocupación de las comunidades huilliches lafkenche de poseer un espacio dedicado a la salvaguarda del patrimonio.
Año 2024 se crea la personalidad juridica del museo, Costera Patagonia.
El año 2025 y gracias el FMIM se logra instalar el laboratorio de conservación del MUIH.
